为进一步适应新时期边防部队遂行任务需要，全面提升医疗服务水平和卫勤保障能力，更好地服务全国边防官兵和人民群众，根据公安部边防局相关改革文件精神，自2014年3月起原广东公安边防总队医院升格为全国公安边防部队总医院。
坐落于深圳市罗湖区凤凰山下清水河畔的边防总医院，创建于1985年，是深圳经济特区内唯一一所有正规编制、集临床医疗、预防保健、康复疗养、科研教学为一体的综合性部队医院，主要担负边防部队官兵的医疗保障任务，同时为驻地群众开展医疗服务。
公安边防部队总医院全貌
三十年奋斗，始终不变爱民情
建院近30年来，该院全体官兵和医务人员始终牢记姓军爱兵为民宗旨，坚持政治建院、科技兴院、质量强院、文化塑院，坚持“内强素质、外树形象”的指导思想，秉承“团结、仁爱、创新、和谐”的发展理念，践行“履行使命，为兵爱民，谋求发展，构建和谐”的庄严承诺，以“服务部队官兵，造福四方百姓”为己任，为边防部队的发展及深圳特区的建设作出了突出贡献，多次赢得地方和部队的褒奖。在1993年清水河大爆炸中，医院卫训大队被公安部授予集体一等功，医院被公安部授予集体三等功。2003年，医院被广东省委宣传部及深圳市委宣传部评为“争当社会主义精神文明建设排头兵”。2007年，公安部在深圳隆重召开表彰大会为医院荣记集体二等功。2008年，医院被全国双拥工作领导小组、民政部、解放军总政治部授予“全国拥政爱民先进集体”。2008年年底，被广东省公安厅评为“改革开放30周年荣誉集体”，被深圳市评为“第九届精神文明先进集体”。2008年、2010年医院医疗队先后赴四川汶川和青海玉树抗震救灾，受到党和国家领导人的亲切接见和积极表彰。多年来，医院发挥部队快速反应、急救能力强等优势，积极开展及时高效的医疗服务和卫勤保障，圆满完成了迎香港澳门回归、海地维和、抗冰抗震、抗击“非典”、“甲流”、援藏、深圳高交会、文博会、奥运会、大运会等重大保障任务。
